剑直直刺中库巴城堡，马力欧因为其造成的冲击被震飞，而必须再次出发寻找碧姬。

马力欧在途中得知能够实现人们愿望的「星星之路」被刺中库巴城堡的剑所破坏，其碎片——「星星碎片」更散落到世界各地。

冒险就此开始，与玛罗、吉诺、库巴和碧姬等在旅途中遇见的可靠同伴一起收集星星碎片，找回愿望有可能实现的和平世界吧。